「アクセスが拒否されました」というようなメッセージどおりで、ファイルのパーミッションが原因でした。
「●●が同期できません」と出たら、その●●が実際にPC側にあるのかをまず探すと思うのですが、パーミッションが変なので、OSで普通に検索しても見つからないファイルとなっています。
直接コマンドラインで探せばすぐ出てきました。
find ~/Dropbox/ -name "[探したいファイル名]"
見つかったファイルのパーミッションを正しく chmod するか、要らないファイルなら削除すれば即同期完了しました。
